Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms