Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3CA6NKF2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms