Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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