Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCDHA12Q9UN75 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms