Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
LINC00474Q9P2X8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms