Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms