Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms