Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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