Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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