Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFHD1Q9BUP0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms