Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TXNDC17Q9BRA2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms