Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FYCO1Q9BQS8 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms