Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms