Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NMD3Q96D46 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NMD3Q96D46 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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