Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUSP18Q8NEJ0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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