Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ATG4DQ86TL0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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