Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRIG3Q6UXM1 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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