Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LINC00242Q5T6M2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms