Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHYHD1Q5SRE7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms