Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SDK2Q58EX2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SDK2Q58EX2 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms