Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC004453.2-201ENST00000624861 2153 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF3-201ENST00000389212 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CAMK1G-202ENST00000361322 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AMMECR1-IT1-201ENST00000418848 561 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TIAM2-201ENST00000275246 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms