Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHD9Q3L8U1 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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