Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RTN1Q16799 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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