Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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