Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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