Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms