Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SMCO1Q147U7 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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