Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CBFBQ13951 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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CBFBQ13951 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CBFBQ13951 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CBFBQ13951 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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