Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE3BQ13370 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE3BQ13370 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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