Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms