Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms