Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
EGR3Q06889 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms