Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms