Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMF1P82094 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMF1P82094 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMF1P82094 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMF1P82094 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMF1P82094 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMF1P82094 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms