Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RPL23P62829 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RPL23P62829 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms