Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FNTAP49354 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms