Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms