Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LHX1P48742 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LHX1P48742 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms