Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MMP13P45452 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MMP13P45452 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MMP13P45452 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MMP13P45452 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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