Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPARGP37231 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms