Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MSX1P28360 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
MSX1P28360 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MSX1P28360 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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MSX1P28360 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MSX1P28360 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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