Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CTSSP25774 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CTSSP25774 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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