Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDCP19113 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDCP19113 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDCP19113 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms