Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DESP17661 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DESP17661 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms