Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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