Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC099794.2-201ENST00000435230 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 DECR1-201ENST00000220764 1207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PABPC5-202ENST00000373105 1262 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RPL6P7-201ENST00000488873 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL645924.2-201ENST00000508865 900 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms