Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TO15178 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TO15178 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TO15178 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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