Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPN9O14815 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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