Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM3A6NNA2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms