Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F8A0AVK6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms